为担子菌亚门的真菌网腥黑粉菌和光腥黑粉菌。网腥黑穗病菌的冬孢子常为圆形或近圆形，有时呈卵圆形，淡灰褐色或深红褐色，直径12~24微米，膜有网状花纹，网眼宽2~4微米，网脊高0.5~1.2微米。光腥黑穗病的冬孢子圆形、卵圆形或稍长，淡灰褐色至暗橄榄褐色，直径15~25微米，膜光滑，无花纹。小麦腥黑穗病菌的冬孢子能在水中萌发，孢子萌发所需的温度随病菌的种和生理小种不同而异，一般最低温度为0~1℃，最高为25~29℃，最适为18~20℃。冬孢子萌发时，先产生管状担子，顶端产生线形担子，不同性别的单核担孢子常成“H”形结合，萌发形成双核侵染丝侵入寄主。        

  小麦腥黑穗病的初侵染来源以种子为主，有的地区土壤、粪肥带菌比重较大。小麦脱粒时，压破病粒，冬孢子分散粘附麦粒表面、麦壳、麦粒上，或落入场土，混入粪肥。小麦腥黑穗病是幼苗侵染型病害，小麦种子发芽时，不同来源的冬孢子也随即萌发，播后4天侵染种皮，7天后侵染胚芽鞘。但当第1叶展开后，病菌一定要经过伤口才能侵入。以后菌丝通过胚芽鞘和叶片基部直接进入生长点，随小麦生长而发展，穗期病菌侵入幼穗的子房，破坏花器，形成病穗。土温9~12℃，土壤湿度在20~22%时，最适宜病菌侵染。因此，冬麦晚播或春麦早播，土温低，出苗慢，或播种时覆土过深，麦苗不易出土，增加了病菌侵染的机会，能加重病害的发生。此外，在地下害虫为害较重的麦田内，腥黑穗病往往发生较重。

        病株一般较健株稍矮，分蘖增多。病穗较短，直立，颜色较健穗深，开始为灰绿色，以后变为灰白色，颖壳略向外张开，露出部分病粒。小麦受害后通常是全穗麦粒变病粒，病粒较健粒短肥，初为暗绿色最后变成灰白色，外面包有一层灰褐色薄膜，里面充满黑粉，这些黑粉就是病菌的冬孢子，捏破后有腥味。 病原及发生规律        

农业防治          (1)及时拔除病株，并将病穗带出田外烧毁或深埋。(2)在播种时，施行粪种隔离，或在带菌的粪肥中加入人粪尿或青草等有机质，堆积腐熟，高温发酵，杀死病菌孢子后再用。 物理防治 　 生物防治 　 药剂防治          种子处理是防治小麦腥黑穗病的主要措施。可选用15%粉锈宁可湿性粉剂，用种子重量的0.1%；或50%多菌灵可湿性粉剂、或769，用种子重量的0.2%拌种。防效分别为89.8~99.1%、100%及97.4%，