病原物为细菌假单胞杆菌属的荧光假单胞菌生物型Pseudomonas fluorescers biovar (Trevisan) Migula。菌体短杆状，短链生，极生2根鞭毛，有荚膜，无芽孢，革兰氏染色阴性，好气性。肉汁胨琼脂平面上菌落白色圆形，薄且光滑，边缘整齐不透明。

病原细菌在土壤中越冬，主要通过雨水或水滴溅射传播蔓延，农事操作，人为接触、果实相碰都可传播，病菌从伤口或水孔侵入，该病在夏季雨季易发病，果实常常尚未成熟引起全果腐烂，严重的烂果遍地。

番茄假单胞果腐病主要为害果实。发病初期出现不规则形褪绿斑，病斑先发白，后逐渐软化而腐烂，内部果肉变为黄褐色至黑褐色，致全果腐烂，里边呈一包稀泥状，流出黄褐色脓水，但无臭味别于软腐病。

(1)要注意轮作，不要与茄科作物连作。(2)棚室栽培番茄要注意调节温度，避免低温高湿条件出现。(3)采用避雨栽培，严禁大水漫灌，浇水时防止水滴溅起，是防止该病的重要措施。(4)发病初期喷洒72%农用硫酸链霉紊可溶性粉剂4000倍液或47%加瑞农可湿性粉剂800倍液、30%碱式硫酸铜悬浮剂400倍液、50%琥胶肥酸铜可湿性粉剂500倍液、77%可杀得可湿性微粒粉剂500倍液、56%靠山水分散微颗粒剂700～800倍液，每亩喷对好的药液65～70升，隔7～10天1次，连续防治2～3次，采收前3天停止用药。