病原物为非荧光假单胞细菌皱纹假单胞菌(番茄髓部坏死病假单胞菌)Pseudomonas corrugata Roberts et Scarlett。积累PHB。具多根极生鞭毛。菌落起皱，淡黄色，有时中央绿色，因菌龄和培养基的差别，菌落呈土黄色至淡黄褐色，产生黄色至黄绿色扩散性非荧光色素。该菌暂列入假单胞杆菌属第五部分。它不能水解果胶酶，也不能使洋葱片腐烂，不能利用D-阿拉伯糖、纤维二糖、己二酸盐、内消旋-酒石酸盐，别于洋葱假单胞菌(P.cepacia)和唐菖蒲假单胞菌(P.gladioli)

病原细菌最初在番茄和苜蓿上存在，经常在第一个坐果完成到成熟的绿果期发病，该病在田间的分布是随机的.容易在低夜温，高氮及高湿条件下发生。

近年细菌性髓部坏死病已在我国个别地区棚室或露地发现。发病初期嫩叶褪绿，严重的植株上部褪绿和萎蔫，伴随着下部茎坏死，病茎表面初生褐色至黑褐色斑，外部变硬，纵剖病茎可见髓部变成黑色或出现坏死，维管束褐变，这些病变多发生在植株外部无病变的地方，髓部发生病变的地方则长出很多不定根。生产上当下部茎被感染时，常造成全株死亡。湿度大时菌脓从茎伤口和不定根溢出，别于溃疡病。

(1)施用酵素菌沤制的堆肥或充分腐熟的有机肥，采用配方施肥技术，避免氮肥施用过多。(2)避免高湿条件出现。(3)发病初期喷洒77%可杀得可湿性粉剂400～500倍液或14%络氮铜水剂300倍液、50%琥胶肥酸铜可湿性粉剂500倍液、1︰1︰200倍式波尔多液等，隔10天左右1次，防治1次或2次。采收前3天停止用药。