病原物为鞭毛菌的亚门真菌瓜果腐霉菌Pythium aphanidermatum (Eds.) Fitzp.。丝体生长繁茂，呈白色棉絮状；菌丝无色，无隔膜。菌丝与孢子囊梗区别不明显。孢子囊丝状或分枝裂瓣状，或呈不规则膨大；泡囊球形，内含6～26个游动孢子；藏卵器球形，雄器袋状至宽棍状，同丝或异丝生，多为1个；卵孢子球形，平滑，不满器。侵染番茄、茄子、辣椒、白菜、葱、韭等多种蔬菜。此外有报道结群腐霉菌Pythium myriotylum Drechser 也可引起此病。

病菌以卵孢子随病残体在土壤中越冬，可营腐生生活，条件适宜时卵孢子萌发，产生芽管，直接侵入幼芽，或芽管顶端膨大后形成孢子囊，以游动孢子借雨水或灌溉水传播到幼苗上，从茎基部侵入，潜育期1～2天。湿度大时，病苗上产出的孢子囊和游动孢子进行再侵染。病菌虽喜34～36℃高温，但在8～9℃低温条件下也可生长，故当花果期遇有连阴雨天气，温度低，光照不足，再遇阴雨高湿，生长衰弱发病重。

番茄绵腐病主要侵害果实。苗期染病引起猝倒。生长期，果实染病生水浸状黄褐色或褐色大斑，致整个果实腐烂，被害果外表不变色，有时果皮破裂。其上密生大量白色霉层是区别于绵疫病的主要特征。

(1)实行轮作,选择3年未种过茄科蔬菜、地势高、排水良好、土质偏沙的地块种植。(2)定植前精细整地，沟渠通畅，做到深开沟、高培土、降低土壤含水量；(3)采用地膜覆盖栽培，避免病原菌通过灌溉水或雨水反溅到植株下部叶片或果实上。(4)加强田间管理，及时整枝打杈，去掉老叶，使果实四周空气流通；及时摘除病果、深埋或烧毁。(5)发病初期可喷58％雷多米尔一锰锌可湿性粉剂500倍液，或75％百菌清可湿性粉剂600倍液，或12％绿乳铜乳油600倍液，或3.2％恶甲水剂300倍液，或64％杀毒矾可湿性粉剂500倍液，或72.2％普力克水剂600倍液，隔7～10天1次，视病情防治1～2次。