病原物为植物病毒烟草花叶病毒Tobacco mosaic virus 简称(TMV)。病毒粒体杆状。钝化温度90～93℃下10分钟，体外存活期72～96小时，在干燥病组织内存活30年以上。这种病毒可以侵染番茄、茄子、辣椒、烟草和藜科的菠菜等，不能侵染瓜类和禾本科植物。

病原能在活的植物体内越冬，也能在土壤中或土壤内的病残体上越冬，还可在种子上沾附的果肉里越冬。主要由汁液传播，故一切粗放的农事操作，都会增加病毒的传播机会，病株与健株的相互摩擦，会增加汁液传染机会。花叶病的发生发展与气温有密切关系。适宜发病温度为20～25℃。种植过密，增加摩擦，病害加重。与茄科植物连作地块，特别是番茄连作，病害会明显加重。肥力不足和排水不畅，造成植株生长不良，往往加重病害发生。土壤中缺少钙、钾、磷等元素，花叶病发生重。黏重且含腐殖质多的土壤保毒期长，会使病害发生严重。

根据花叶的轻重和叶片是否畸形可分为2种情况。(1)轻花叶。表现出绿色深浅不匀的斑驳，叶片不变小，不畸形，植株不矮化，对产量影响不大。(2)重花叶。叶片黄绿，花叶明显凹凸不平，新叶片变小、细长、畸形、扭曲，叶脉变紫，植株矮化，花芽分化能力减退，大量落花落蕾，果小质劣呈花脸状，对产量影响很大，病株比健株减产10%～30%。番茄花叶病毒病易与缺氮混淆。两者比较：缺氮先是老叶叶色失绿变黄，最后全部叶片变黄，不结果或结果少且小而黄，植株矮小，叶片黄化；番茄花叶病毒病先是嫩叶发病，失绿，大多数病叶的黄绿色的斑驳，叶片变形。

(1)播种前，先用清水浸泡种子3～4小时，再放到10%的磷酸三钠溶液中浸种20～30分钟，捞出用清水冲洗干净后催芽播种。或将干燥的种子在70℃下干热消毒72小时。(2)选用抗病品种，目前大多数番茄品种都抗烟草花叶病毒，各地应因地制宣选用适于本地栽培的较抗病品种。(3)与瓜类或禾本科类作物实行3年以上轮作。采收完后及时清除病残体，在远离菜地、水源的地方处烧毁或挖坑深埋。(4)育苗前，苗床彻底清除枯枝残叶和杂草；定植前深翻土壤，促使病残体腐烂；对病田里用过的工具、架材要进行消毒处理。(5)打权、整枝、绑蔓时先健株后病株，接触过病株的手要用肥皂水消毒，防止通过农事操作再次传播。(6)增施钙、磷、钾肥，适时早播和定植。部分粮菜混作区，将晚夏番茄定植在小麦田预留的行间，生长前期病毒病明显轻于空地块。番茄行间采取铺草保湿等措施，也有利于减轻病害。(7)病害始发期，用3.85%三氮唑核苷铜锌可湿性粉剂、或20%毒克星可湿性粉剂、或20%盐酸吗啉呱锌可溶性粉剂、或20%盐酸吗啉呱铜可溶性粉剂等4种药物，可以使轻微的花叶病病情受到抑制，发病率也可以降低。