病原物为鞭毛菌亚门真菌萝卜丝囊霉Aphanomyces raphani Kendr.。藏卵器亚球形或近球形，顶生于通常较短的分枝上，壁的内表面呈波纹状，卵孢子椭圆形或亚球形，近无色至深黄色，雄器顶生，多弯曲常分枝。菌丝分枝不太繁茂，游动孢子囊由营养菌丝一端产生隔膜直接形成，成熟后释放出几十至几百个游动孢子，游动孢子先成群休止，休止时球形，不久即分散，多先生一乳头，从乳头处再释放出若干长有二根鞭毛的游动孢子，有时游动孢子休止后可直接萌发，长出芽管。

病菌可在土壤中营腐生生活，以藏卵器和菌丝体在土壤中越冬，翌春土壤中水分充足时，产生孢子囊，孢子囊释放出大量游动孢子，发芽后穿透幼苗子叶下轴或根部外皮层侵入，经潜育即发病。该病发生与土壤水分关系密切，病菌在20℃左右生长良好，土壤温度低，出苗缓慢，有利于病菌侵入则易发病，排水不良、土壤粘重及反季节栽培发病重。

该病后期显症，症状出现在侧根生长的部位，病部外皮变成紫色至黑色把根毛围住，被围部位缩小且开裂，未遭侵染的健组织继续生长，染病萝卜出现变色的部位似辐射状条纹向里扩展，致组织变硬，无食用价值。

(1)床土消毒，床土应选用无病新土，如用旧园土，有带菌可能，应进行苗床土壤消毒。方法：每平方米苗床施用50%拌种双粉剂7克，或25%甲霜灵可湿性粉剂9克加70%代森锰锌可湿性粉剂1克对细土4～5千克拌匀，施药前先把苗床底水打好，且一次浇透，一般17～20cm深.水渗下后，取1/3充分拌匀的药土撒在畦面上，播种后再把其余2/3药土覆盖在种子上面，即上覆下垫。如覆土厚度不够可补撒堰土使其达到适宜厚度，这样种子夹在药土中间，防效明显，残效月余。(2)加强苗床管理，选择地势高、地下水位低，排水良好的地做苗床，播前一次灌足底水，出苗后尽量不浇水，必须浇水时一定选择晴天喷洒，不宜大水漫灌。(3)育苗畦(床)及时放风、降湿，即使阴天也要适时适量放风排湿，严防幼苗徒长染病，(4)发病初期喷洒20%甲基立枯磷乳油1200倍液或72%杜邦克露可湿性粉剂1000倍液、72.2%普力克水剂400倍液，每平方米喷淋对好的药液2～3升，或15%恶霉灵(土菌消)水剂450倍液，每平方米3升。