病原物为半知菌亚门的真菌茄链格孢Alternaria solani (Ell et Mart.) Jones et Grout.。分生孢子梗单生或丛生，梗暗褐色，具隔膜3～6个；分生孢子顶生或串生，倒棍棒状或圆筒形．具横隔膜2～6个，纵隔膜0～5个，淡黄褐色，有长喙；喙无色，透明，具横隔0～2个。侵染辣椒、甜椒、番茄、茄子、马铃薯。

以菌丝或分生孢子在病残体或种子上越冬，可从气孔、皮孔或表皮直接侵入，形成初侵染，经2—3天潜育后现出病斑，3～4天产出分生孢子，并通过气流、雨水进行多次重复侵染。当番茄进入旺盛生长及果实迅速膨大期，基部叶片开始衰老，病菌在番茄田上空得以积累，这时遇有持续5天均温21℃左右，降雨2.2～46毫米，相对湿度大于70％的时数大于49小时，该病即开始发生和流行。因此，每年雨季到来的迟早，雨日的多少，降雨量的大小和分布，均影响相对湿度的变化及早疫病的扩展。此外，该菌属兼性腐生菌，田间管理不当或大田改种番茄后，常因基肥不足发病重。

主要为害叶片，叶上病斑圆形或长圆形，大小2～6mm，黑褐色，具同心轮纹。空气潮湿时，上生黑色霉层，即病菌繁殖体。为害严重时，整个叶片可分布十几个病斑，严重影响光合作用。

(1)保护地重点抓生态防治。由于早春定植时昼夜温差大，白天20～25℃，夜间12～15℃，相对湿度高达80％以上，易结露，利于此病的发生和蔓延。应重点调整好棚内温湿度，尤其是定植初期，闷棚时间不宜过长，防止棚内湿度过大温度过高，做到水、火、风有机配合，减缓该病发生蔓延。(2)按配方施肥要求，充分施足基肥，适时追肥，提高寄主抗病力。(3)种植耐病品种，如茄抗5号、毛粉802、烟粉1号、陇番5号、粤胜、奇果、矮立元、密植红等。此外，番茄抗早疫病品系NCEBRl和Nc EBR2可用于抗病亲本，选育抗病品种。(4)大面积轮作。应与番茄、马铃薯等实行3年以上轮作。(5)合理密植。以亩定植4000株为宜，前期产量虽低，但中期产量高，小果少，发病轻。(6)发病初期棚室可采用烟尘法喷撒5％百菌清粉尘剂，每亩次1kg，隔9天1次，连续防治3～4次。或用45％百菌清烟剂或10％速克灵烟剂．每亩次200～250g。露地需在发病前开始喷洒80％喷克可湿性粉剂600倍液，或50％扑海因可湿性粉剂1000倍液，或75％百菌清可湿性粉剂600倍液，或58％甲霜灵·锰锌可湿性粉剂500倍液，或64％杀毒矾可湿性粉剂500倍液，或40％大富丹可湿性粉剂400倍液，或50％得益可湿性粉剂600倍液。上述保护剂对早疫病防效高低的关键，在于用药的迟早。凡掌握在发病前看不见病斑即开始喷药预防的，防效70％以上；发病后用药虽有一定抑制作用，但不理想。