病原物为鞭毛菌亚门的真菌辣椒疫霉Phytophthora capsici Leonian。菌丝丝状，无隔膜，生于寄主细胞间或细胞里；孢子囊梗无色，丝状；孢子囊顶生，单胞，卵圆形；厚垣孢子球形，单胞，黄色，壁厚平滑；卵孢子球形，雄器有时见不到。

病菌主要以卵孢子、厚垣孢子在病残体或土壤及种子上越冬，其中土壤中病残体带菌率高，是主要初侵染源。北方寒冷地区病菌不能在种子上越冬，其主要来源是土壤中和在病残体上越冬的卵孢子。条件适宜时，越冬后的病菌经雨水飞溅或灌溉水传到茎基部或近地面果实上，引起发病。重复侵染主要来自病部产生的孢子囊，借雨水传播为害。病菌生长发育适温30℃，最高38℃，最低8℃。田间温度25～30℃，相对湿度高于。85％发病重。一般雨季，或大雨后天气突然转晴，气温急剧上升，病害易流行。土壤湿度95％以上，持续4～6小时，病菌即完成侵染，2～3天就可发生一代，因此成为发病周期短、流行速度迅猛异常的毁灭性病害。易积水的辣椒田，定植过密，通风透光不良发病重。

苗期、成株期均可受疫病为害，茎、叶和果实都能发病。苗期发病，茎基部呈暗绿色水浸状软腐或猝倒，即苗期猝倒病；有的茎基部呈黑褐色，幼苗枯萎而死；叶片染病，病斑圆形或近圆形，直径2～3cm，边缘黄绿色，中央暗褐色；果实染病始于蒂部，初生暗绿色水浸状斑，迅速变褐软腐，湿度大时表面长出白色霉层，即病原菌孢囊梗和孢子囊，干燥后形成暗褐色僵果，残留在枝上；茎和枝染病，病斑初为水浸状，后出现环绕表皮扩展的褐色或黑褐色条斑，病部以上枝叶迅速凋萎c；上述症状常因发病时期、栽培条件而略有不同。塑料棚或北方露地，初夏发病多，首先为害茎基部，症状表现在茎的各部，其中以分杈处茎变为黑褐色或黑色最常见；如被害茎木质化前染病，病部明显缢缩，造成地上部折倒，且主要为害成株，植株急速凋萎死亡，成为甜(辣)椒生产上的毁灭性病害。

(1)前茬收获后及时清洁田园，耕翻土地，采用菜粮或菜豆轮作，提倡垄作或选择坡地种植。(2)选用早熟避病或抗病品种。如麻辣、猪大肠、细线椒等。(3)培育适龄壮苗，适度蹲苗，定植苗龄以80天左右为宜，不宜过长。但要求达到壮苗指标，即株高15～20cm，茎粗0.2cm，80％现蕾，亩定植3200～3500株。(4)按配方施肥。喷洒爱多收6000倍液或植宝素7000倍液，提高抗病力。(5)加强田间管理。蹲苗后进入枝叶及果实旺盛生长期，促秧攻果返秧防衰四次肥水不可少；进入高温雨季，气温高于32℃，尤其要注意暴雨后及时排除积水，雨季应控制浇水，严防田间或棚室湿度过高。(6)种子消毒：先把种子经52℃温水浸种30分钟或清水预浸10～12小时后，用1％硫酸铜液浸种5分钟，捞出后拌少量草木灰；也可用72.2％普力克水剂、或0.1％的20％甲基立枯磷乳油浸种12小时，洗净后晾干催芽。(7)前期掌握在发病前，喷洒植株茎基和地表，防止初侵染；进入生长中后期以田间喷雾为主，防止再侵染；田间发现中心病株后，须抓准时机，喷洒与浇灌并举。及时喷洒和浇灌50％甲霜铜可湿性粉剂800倍液，或70％乙膦·锰锌可湿性粉剂500倍液，或72.2％普力克水剂600～800倍液，或72％杜邦克露或克霜氰或霜脲锰锌可湿性粉剂600～700倍液，对上述杀菌剂产生抗药性时，可改用69％安克锰锌可湿粉剂1000倍液，此外，于夏季高温雨季浇水前亩撒96％以上的硫酸铜3kg，后浇水，防效明显。棚室保护地也可选用烟熏法或粉尘法，即于发病初期用45％百菌清烟雾剂，每亩次250～300g，或5％百菌清粉尘剂，每亩次1kg，隔9天左右一次，连续防治2～3次。