该病可由多种真菌侵染引起。主要病原有链格孢、尖镰孢菌、德巴利腐霉和齐整小核菌。
链格孢Alternaria tenuis Nees,分生孢子梗分枝或不分枝,淡榄褐色至绿褐色,屈曲,顶端孢痕多个。分生孢子10个呈长链生,具喙或无喙,椭圆形、卵形、肾形、倒棍棒形至圆筒形,平滑或具瘤,具横隔1~9个,纵隔0~6个,淡榄褐色至深榄褐色,该菌寄生性不强,但寄主范围广。
尖镰孢菌Fusarium oxysporum Schlecht,子座灰褐色。大型分生孢子在子座或粘分生孢子团里生成,镰刀形,弯曲,基部有足细胞,多3隔膜,也有5个隔膜的。小型分生孢子1~2个细胞,卵形或肾脏形,多散生在菌丝间,一般不与大型分生孢子混生。厚垣孢子球形,平滑或具褶,大多单细胞,顶生或间生。该菌还可侵染番茄、马铃薯、甜瓜、草莓等。
德巴利腐霉Pythium debaryanum Hesse,孢子囊球形至卵形。卵孢子球形,平滑,不满器,壁薄。
齐整小核菌Sclerotium rolfsii Sacc.为半知菌亚门真菌,有性态为担子菌亚门真菌罗耳阿太菌Athelia rolfsii (curzi) Tu. & Kimbrough.。在PDA培养基上菌丝体白色,茂盛,呈辐射状扩展。菌丝分枝不成直角,具隔膜。菌核初为乳白色,后变浅黄色至茶褐色或棕褐色,球形至卵圆形,表面光滑具光泽,由3层细胞组成,外层棕褐色,表皮层下为假薄壁组织,中间为疏丝组织。无性态。