病原物为子囊菌亚门茄褐纹间座壳Diaporthe vexans (Sacc. et Syd.) Gatz.。有性态自然条件下少见,如有则多长在茎或果实上的老病斑上。子囊壳多2~3个聚生在一起,球形或卵形,有不整齐的喙部。子囊倒棍棒形,无柄。子囊孢子双胞,无色透明,长椭圆形或钝纺锤形,横隔处稍缢缩。无性态为半知菌亚门真菌茄褐纹拟茎点霉Phomopsis
vexans (Sacc. et Syd.) Hartter.。分生孢子器埋生于寄主表皮下,成熟后突破表皮外露,球形或扁球形。分生孢子器内可产生两种分生孢子:一种为椭圆形,另一种为丝状并一端弯曲呈钩状,两种孢子均为无色,单胞。一般椭圆形孢子占多数,丝状孢子少见,如有则长在茎杆及果实上的分生孢子器内,且不能萌发。病菌在各种培养基上均能生长,俚在查伯克氏(Czapek)组合培养基上生长良好,产生大量分生孢子器,病菌发育温度范围7~40℃,最适温度为28~30℃。形成分生孢子器的适温为30℃。分生孢子在清水中不能萌发,而在新鲜茄汁浸出液中萌发最好。在自然条件下病菌可侵染茄子、辣椒,以侵染茄子为主。